Le service de mise à l’abri assure l’hébergement et l’accompagnement socio-éducatif des personnes orientées par le service d’évaluation. Il offre une mise à l’abri inconditionnelle et garanti un temps de répit avant l’évaluation de la minorité et de l’isolement. Il répond aux besoins des jeunes notamment par la mise en place d’activités éducatives, culturelles, artistiques, sportives et citoyennes par exemple. De plus, le service réalise le recueil d’informations contribuant à l’évaluation de la minorité et de l’isolement des personnes accueillies et à l’appréciation de leur autonomie en vue de leur orientation. Enfin, en concertation avec la Cellule d’évaluation et d’orientation des mineurs non accompagnés (CEOMNA), l’équipe éducative prépare au départ les mineurs faisant l’objet d’une admission à l’Aide sociale à l’enfance.
Durant la mise à l’abri, tous les jeunes accueillis bénéficient d’une première évaluation de leurs besoins en santé et peuvent être orientés vers des structures de soin spécialisées grâce à la présence d’une équipe de santé dédiée.